商业特许经营企业进行备案的流程、所需材料和条件如下：

特许备案办理条件：

1、一家注册时间满一年的公司作为备案主体公司（特许人）

2、注册成功拿到商标证的商标（和备案项目匹配的类别，注册成功满一年）；

3、两家经营满一年的直营店（控股51%股东及配偶的个体户、分公司、主体公司控股51%子公司均可），特殊行业需要行业经营资格证。

特许备案需准备材料清单：

1.公司营业执照副本及工商调档章程彩色扫描件；

2.法人及公司联系人身份证正反面原件彩色扫描件，固话、手机号、邮箱；

3.商业特许经营合同word版；

4.与公司签的第一份加盟协议；

5.商标注册证彩色扫描件（如与特许人不一致，需提供商标许可使用授权书）；

6.两家直营店营业执照副本及食品经营许可证和房屋租赁合同及产权证明彩色扫描件，需提供门头及店内环境照片3-4张；

7.特许经营操作手册目录；

8.计划店铺分布情况，加盟店和直营店提供省、市信息即可，如：直营店 北京，加盟店山西太原；

特许备案办理流程：

1. 确认需求：了解办理时间和费用，签订服务合同（如果选择第三方服务）。

2. 提交材料：向商务主管部门提交上述准备好的材料。

3. 线上填报：首次订立特许经营合同后15日内，在商务部商业特许经营信息管理系统填报电子版信息。

4. 审核与公告：商务局进行线上审核，审核通过后在系统中公告。

请注意，具体流程和要求可能会随时间及地区政策的更新而有所变化，建议直接咨询商务主管部门或专业机构以获取最新信息。