商业特许经营备案的办理流程主要包括以下步骤：‌ ‌网上注册‌：‌特许人需在与中国境内的被特许人订立第一份特许经营合同之日起15日内，‌登录到商业特许经营信息管理系统网站进行网上注册。‌‌ ‌填报电子版信息‌：‌注册登录后，‌特许人需要按照系统要求完整填报备案材料的电子版信息。‌‌

‌提交纸质材料‌：‌特许人向接受窗口提交申请备案的纸质材料，‌包括商业特许经营基本情况、‌两家以上直营店情况等相关证明文件。‌‌ ‌审核与公告‌：‌审核部门对特许人提交的纸质和系统上的备案资料进行审核。‌对于符合规定的申请材料，‌自材料收到起10天内予以备案，‌并在商业特许经营信息管理系统上予以公告。‌‌